日本地震工学会の活動のため、理事会や各種委員会が組織され、運営されています。
社員総会は、全社員(学会員)の参加によって行われる会の最高決議機関です。
公益社団法人日本地震工学会第10回社員総会は、2022年5月24日に開催されました。
第10回社員総会は、新型コロナウィルス対策の為、Zoomによるオンライン形式で開催いたしました。
理事会は、会長と理事によって構成される会の業務執行機関です。
本会の役員は、会長、副会長、理事、監事からなります。
会長と副会長は、理事会の決議により理事の中から選定されます。その際、会長については正会員の選挙によって選ばれた会長候補者（1名）が参考にされます。
理事と監事は、社員総会の決議により選任されますが、監事については正会員の選挙により選ばれた者を監事候補者（2名）とします。
会長、副会長、理事、監事の任期は2年です。現会長と次期会長候補者が情報を共有しかつ意見交換が行われるように、会長選挙および監事選挙は交代年の前年に同時に実施されます。
2007年度から、各年度ごとに事業報告書を作成・公表しています。
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